Seleksi substansi LPDP adalah sebuah tes untuk mengukur kemampuan pelamar dalam hal substansi keilmuan, kontribusi kepada Indonesia, dan komunikasi sosial. Dalam program beasiswa LPDP seleksi substansi akan diisi beberapa kegiatan yang intinya adalah proses verifikasi. Yakni verifikasi terhadap seluruh berkas yang dilampirkan saat pendaftaran. Mulai dari verifikasi data diri sesuai CV yang dilampirkan, proses menulis essay untuk verifikasi komitmen kembali ke Indonesia dan sebagainya, sampai wawancara untuk berbagai tujuan agar pihak penyelenggara yakin pelamar adalah kandidat yang tepat.